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Arlequin人类遗传学数据分析软件

Arlequin人类遗传学数据分析软件

v3.5.2.2 Arlequin是一款专业的人类基因数据分析 评分:3
下载地址
  • 软件大小:24.76M
  • 软件语言:简体中文
  • 更新时间:2021-04-13 14:35:18
  • 软件类别:免费软件/办公软件
  • 软件性质:PC软件
  • 软件厂商:
  • 运行环境:Win8,Win7,WinXP,Win2003,Win2000
  • 软件等级:
  • 相关推荐: 数据分析平台 数据分析软件
  • 软件介绍
  • 软件截图
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Arlequin是一款专业的人类基因数据分析软件,为从事医学和生物学研究的学者设计,具有AMOVA计算、中性检测、错配分布等功能。例如,大量的分子序列数据和传统的基因频率提供了许多方法和统计测试,可以满足用户对各种基因分析的便利需求。  

功能说明

1、Molecular diversity(分子多态性)

2、Mismatch distribution(错配分布)

3、Haplotype frequency estimation(单倍型频率估计)

4、Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检测不同位点上等位基因的非随机关联)

5、Hardy-Weinberg equilibrium(哈温—伯格平衡)

6、Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验)

7、Fu`s neutrality test(Fu中性检验)

8、Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验)

以上三个中性检验都是基于无限位点模型,适用于DNA sequence 和 RFLP单倍型。

9、Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合检验,检测人群的均一性或同质性和中性选择等)

10、Minimu Spanning Network(MSN,最小扩张树或称之为最小支撑树,,基于分子差异)

11、AMOVA 分子差异度分析,用以评测人群的遗传结构

12、Pairwise genetic distances (遗传距离的估计)

13、Exact test of population differentiation (检测随机交配群体单倍型的非随机分布)

14、Assignment test of genotype (通过估计等位基因频率将单个基因型分配到特定的人群中)

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  • Arlequin人类遗传学数据分析软件

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